OGT关注针对小型NGS癌症产品，计划推出基于阵列的ce-ivdNIPT
上周，位于英国的Oxfordshire分子遗传学公司退出了一款卵巢癌产品和一个试剂盒，公司的研究和开发副总裁John Anson表示，这将是一系列基于NGS的产品的第一种。
“这将会进入一个更具有针对性和特定疾病的领域，”Anson在采访中这样表示。
去年，公司推出了一款针对60个实体瘤基因的面板，这款产品是与南安普顿大学，伯明翰大学以及英国分层卫生保健计划的一部分CIS医学联合开发的。虽然这个产品包含了范围广泛的实体瘤相关基因，但是Anson表示，现在公司将关注更小范围，更特异的产品。
例如，卵巢癌的产品奖仅仅靶向7个基因-BRCA1，BRCA2，TP53，PTEN，ATM，ATR和NF1。公司计划研究针对不同实体瘤及血液癌症的靶向产品，并且已经提供了一个25基因的骨髓产品。然而，在未来，Anson说，公司还将研发针对特定血液疾病的更小的产品。
他表示，公司现在将NGS产品定位在为转化研究客户，像医院和学术机构的大型癌症研究所，这些机构会使用这些产品来确定预后标记，这些标记能够告知药物反应和新的药物靶标。
“我们想将研究与新的潜在疗法联系在一起，”他说。
Anson补充说，该公司还将于客户合作，设计一些癌症产品，以确保包括相关基因。
NGS癌症产品市场竞争尤为激烈。主要的NGS公司-Illumina和Thermo Fisher Scientific-占有大部分癌症产品市场，安捷伦和RainDance Technologies也做样品处理，并且许多学术研究机构也自己研发相关产品。
尽管如此，Anson表示，OGT擅长于诱饵设计，这将帮助与对手竞争。“我们做诱饵设计有经验化优势，”他说。“而不仅仅是依赖于不公可用的软件。”此外，该公司还是用自己的软件在后台进行分析。
虽然OGT是一家以芯片而出名的公司，但是其现在已经运行了超过6000分NGS样品。
OGT研发部主任GrahamSpeight表示，公司也将通过整个靶向区域提供其维持机制的产品，甚至包括整个覆盖区域，这对于某些体细胞的突变十分重要，因为在卵巢癌的产品中，小等位基因的频率可以低于1%。此外，对于一些肿瘤抑制基因，例如在卵巢癌的产品中，覆盖整个基因是至关重要的，因为通过整个基因的检测，可以发现突变基因，虽然突变往往是集中在突变热点区域的。“你需要覆盖每个外显子的碱基，这样才能得到你需要的灵敏性，”他说。
此外，Anson说，OGT也将提供配套产品。去年，其收购了位于伦敦的基于荧光原位杂交的Cytocell公司。Anson表示，Cytocell荧光原位杂交产品以及OGT的独有的细胞遗传学产品是一个良好的补充。“使用该技术来看拷贝数变异和用于SNVs的NGS之间具有一个良好的交叉作用，”Anson说。
虽然该公司最初关注的是临床和转化研究市场，但是其所有的NGS产品仅仅用于研究市场，Anson表示公司现在讲着眼临床市场。
“如果这些检测被发现对于诊断室重要的，我们将准备走管理路线，”Anson说。“我们已经使用我们的FISH产品完成了一些，并且我们正在努力朝监管方向努力。”
Anson预计，癌症产品可能会逐渐接近，甚至被机关机构批准，当然是指那些关注在临床前工作中发现，对于治疗，诊断和预后具有相关性的基因或者特定突变。
除了癌症，该公司还在研发美国宪法允许的产品，并且打算进入到无创产前检测市场。
在年底之前，OGT计划一个叫做CE-IVD的NIPT申请给欧洲监管局，并希望能够2016年启动该测试。目前，公司正在进行临床检测试验，这项产品奖主要使用微阵列技术来筛查唐氏综合症。
Anson说，公司决定基于阵列平台，而不是NGS的NIPT，这是因为其可以有一个更快的周转时间和潜在的更低的成本。微阵列NIPT的周转时间可以在三天内轻松完成。目前，NIPT公司提供的基于NGS的检测，测试的周转时间大概是7-10天。
与其他的产品相类似，OGT计划将NIPT做成一个试剂盒，而不是检测服务。
OGT也提供基于阵列的胚胎移植前的基因筛查检测，Anson表示，在可预见的未来，该公司不会转化成基于NGS的技术。
该公司还将关注基于阵列的用于宪法允许的疾病的研究，然而，Anson表示，基于NGS的产品卡可以补充OGT市场上的基于阵列的产品。当前，公司市场主要是医学研究的外显子阵列，这是由Emory遗传学实验室结合设计的。
这个阵列含有增强的4600个与医疗研究相关的基因，并且这些基因已经根据特异性症状进行了分组。OGT设计其主要是用来与外显子测序互补的，EGL对冲基金执行主任Madhuri Hegde表示，OGT的阵列和EGL独有的医疗外显子检测联合，可以有更好地针对缺失和增多的更好效果。
OGT也将关注一些列其他遗传疾病的阵列研究，包括自闭症，杜氏肌萎缩症，癫痫，智力障碍，听力丧失和代谢紊乱等。
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